Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPRD1AQ96P16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPRD1AQ96P16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPRD1AQ96P16 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPRD1AQ96P16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPRD1AQ96P16 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms