Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKRD27Q96NW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD27Q96NW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ANKRD27Q96NW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD27Q96NW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms