Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNBD2Q96M20 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD2Q96M20 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNBD2Q96M20 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNBD2Q96M20 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNBD2Q96M20 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms