Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C2orf48Q96LS8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C2orf48Q96LS8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C2orf48Q96LS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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