Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATXN7L3BQ96GX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN7L3BQ96GX2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN7L3BQ96GX2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN7L3BQ96GX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms