Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB1Q96FW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUB1Q96FW1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUB1Q96FW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUB1Q96FW1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms