Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00526Q96FQ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00526Q96FQ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms