Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HAVCR1Q96D42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HAVCR1Q96D42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms