Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TM4SF18Q96CE8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TM4SF18Q96CE8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF18Q96CE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms