Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APH1BQ8WW43 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
APH1BQ8WW43 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APH1BQ8WW43 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APH1BQ8WW43 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms