Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM239Q8WW34 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM239Q8WW34 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM239Q8WW34 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM239Q8WW34 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335.4 ms