Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF217Q8TC41 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF217Q8TC41 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RNF217Q8TC41 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms