Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF397Q8NF99 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF397Q8NF99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF397Q8NF99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF397Q8NF99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF397Q8NF99 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms