Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBOF1Q8ND07 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBOF1Q8ND07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBOF1Q8ND07 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBOF1Q8ND07 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBOF1Q8ND07 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms