Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX31Q8N9S9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX31Q8N9S9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX31Q8N9S9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX31Q8N9S9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms