Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00337Q8N6G1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00337Q8N6G1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00337Q8N6G1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms