Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFNL1Q8IU54 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFNL1Q8IU54 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFNL1Q8IU54 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFNL1Q8IU54 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFNL1Q8IU54 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFNL1Q8IU54 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFNL1Q8IU54 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFNL1Q8IU54 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IFNL1Q8IU54 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IFNL1Q8IU54 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms