Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCD3Q6STE5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMARCD3Q6STE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMARCD3Q6STE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms