Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUI8

C19orf48, Uncharacterized protein C19orf48, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf48Q6RUI8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C19orf48Q6RUI8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C19orf48Q6RUI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C19orf48Q6RUI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C19orf48Q6RUI8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C19orf48Q6RUI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms