Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LARP1Q6PKG0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LARP1Q6PKG0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LARP1Q6PKG0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.82■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LARP1Q6PKG0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
LARP1Q6PKG0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LARP1Q6PKG0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms