Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LMOD2Q6P5Q4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
LMOD2Q6P5Q4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LMOD2Q6P5Q4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMOD2Q6P5Q4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LMOD2Q6P5Q4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms