Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN1Q6NZI2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CAVIN1Q6NZI2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAVIN1Q6NZI2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAVIN1Q6NZI2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms