Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV0

FOXB2, Forkhead box protein B2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB2Q5VYV0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXB2Q5VYV0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXB2Q5VYV0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXB2Q5VYV0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXB2Q5VYV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXB2Q5VYV0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms