Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVC0

C1orf146, Uncharacterized protein C1orf146, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf146Q5VVC0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf146Q5VVC0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf146Q5VVC0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1orf146Q5VVC0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf146Q5VVC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf146Q5VVC0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms