Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL39P5Q59GN2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL39P5Q59GN2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL39P5Q59GN2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL39P5Q59GN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL39P5Q59GN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL39P5Q59GN2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL39P5Q59GN2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms