Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RSPO4Q2I0M5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RSPO4Q2I0M5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RSPO4Q2I0M5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPO4Q2I0M5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPO4Q2I0M5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPO4Q2I0M5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1110.5 ms