Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ME3Q16798 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ME3Q16798 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ME3Q16798 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ME3Q16798 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ME3Q16798 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ME3Q16798 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ME3Q16798 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ME3Q16798 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ME3Q16798 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ME3Q16798 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ME3Q16798 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ME3Q16798 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ME3Q16798 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ME3Q16798 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ME3Q16798 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ME3Q16798 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ME3Q16798 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ME3Q16798 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ME3Q16798 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ME3Q16798 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ME3Q16798 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ME3Q16798 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ME3Q16798 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ME3Q16798 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ME3Q16798 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ME3Q16798 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ME3Q16798 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ME3Q16798 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ME3Q16798 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ME3Q16798 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ME3Q16798 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ME3Q16798 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ME3Q16798 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ME3Q16798 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ME3Q16798 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ME3Q16798 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ME3Q16798 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ME3Q16798 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ME3Q16798 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ME3Q16798 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ME3Q16798 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ME3Q16798 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ME3Q16798 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ME3Q16798 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ME3Q16798 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ME3Q16798 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ME3Q16798 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ME3Q16798 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ME3Q16798 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ME3Q16798 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ME3Q16798 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ME3Q16798 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ME3Q16798 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ME3Q16798 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ME3Q16798 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ME3Q16798 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ME3Q16798 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ME3Q16798 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ME3Q16798 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ME3Q16798 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ME3Q16798 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ME3Q16798 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ME3Q16798 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ME3Q16798 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ME3Q16798 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ME3Q16798 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ME3Q16798 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ME3Q16798 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ME3Q16798 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ME3Q16798 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ME3Q16798 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ME3Q16798 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ME3Q16798 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ME3Q16798 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ME3Q16798 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ME3Q16798 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ME3Q16798 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ME3Q16798 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ME3Q16798 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ME3Q16798 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ME3Q16798 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ME3Q16798 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ME3Q16798 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ME3Q16798 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ME3Q16798 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms