Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAM1Q15629 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAM1Q15629 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAM1Q15629 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAM1Q15629 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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