Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RABEP1Q15276 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RABEP1Q15276 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RABEP1Q15276 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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RABEP1Q15276 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
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RABEP1Q15276 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABEP1Q15276 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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RABEP1Q15276 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
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RABEP1Q15276 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RABEP1Q15276 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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