Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM2Q15035 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM2Q15035 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAM2Q15035 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAM2Q15035 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms