Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPNMBQ14956 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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GPNMBQ14956 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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GPNMBQ14956 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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GPNMBQ14956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GPNMBQ14956 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
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GPNMBQ14956 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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GPNMBQ14956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GPNMBQ14956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
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GPNMBQ14956 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPNMBQ14956 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
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GPNMBQ14956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GPNMBQ14956 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GPNMBQ14956 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GPNMBQ14956 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPNMBQ14956 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GPNMBQ14956 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GPNMBQ14956 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
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GPNMBQ14956 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPNMBQ14956 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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