Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PDE6HQ13956 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDE6HQ13956 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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PDE6HQ13956 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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PDE6HQ13956 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDE6HQ13956 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDE6HQ13956 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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