Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTAN1Q13813 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPTAN1Q13813 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTAN1Q13813 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPTAN1Q13813 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms