Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMAD4Q13485 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMAD4Q13485 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMAD4Q13485 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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