Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NR1H3Q13133 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1H3Q13133 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1H3Q13133 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1H3Q13133 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1H3Q13133 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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