Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB40BQ12829 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB40BQ12829 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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RAB40BQ12829 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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RAB40BQ12829 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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RAB40BQ12829 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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RAB40BQ12829 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB40BQ12829 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB40BQ12829 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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