Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFRSF9Q07011 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF9Q07011 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF9Q07011 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF9Q07011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms