Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
XPCQ01831 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
XPCQ01831 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
XPCQ01831 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
XPCQ01831 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
XPCQ01831 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
XPCQ01831 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
XPCQ01831 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
XPCQ01831 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
XPCQ01831 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
XPCQ01831 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
XPCQ01831 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
XPCQ01831 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
XPCQ01831 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
XPCQ01831 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
XPCQ01831 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
XPCQ01831 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
XPCQ01831 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
XPCQ01831 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
XPCQ01831 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
XPCQ01831 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
XPCQ01831 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
XPCQ01831 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
XPCQ01831 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
XPCQ01831 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
XPCQ01831 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
XPCQ01831 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
XPCQ01831 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
XPCQ01831 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
XPCQ01831 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
XPCQ01831 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
XPCQ01831 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
XPCQ01831 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
XPCQ01831 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
XPCQ01831 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
XPCQ01831 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
XPCQ01831 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
XPCQ01831 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
XPCQ01831 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
XPCQ01831 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
XPCQ01831 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
XPCQ01831 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
XPCQ01831 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
XPCQ01831 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
XPCQ01831 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
XPCQ01831 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
XPCQ01831 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
XPCQ01831 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
XPCQ01831 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
XPCQ01831 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
XPCQ01831 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
XPCQ01831 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
XPCQ01831 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
XPCQ01831 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
XPCQ01831 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
XPCQ01831 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
XPCQ01831 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
XPCQ01831 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
XPCQ01831 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
XPCQ01831 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
XPCQ01831 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
XPCQ01831 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
XPCQ01831 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
XPCQ01831 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
XPCQ01831 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
XPCQ01831 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
XPCQ01831 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
XPCQ01831 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
XPCQ01831 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
XPCQ01831 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
XPCQ01831 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
XPCQ01831 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
XPCQ01831 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
XPCQ01831 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
XPCQ01831 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
XPCQ01831 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
XPCQ01831 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
XPCQ01831 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
XPCQ01831 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
XPCQ01831 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
XPCQ01831 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
XPCQ01831 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
XPCQ01831 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
XPCQ01831 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
XPCQ01831 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
XPCQ01831 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
XPCQ01831 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
XPCQ01831 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
XPCQ01831 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
XPCQ01831 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
XPCQ01831 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
XPCQ01831 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
XPCQ01831 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
XPCQ01831 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
XPCQ01831 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
XPCQ01831 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
XPCQ01831 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
XPCQ01831 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
XPCQ01831 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
XPCQ01831 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms