Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC5Q00444 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC5Q00444 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC5Q00444 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC5Q00444 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms