Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CNTNAP1P78357 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CNTNAP1P78357 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CNTNAP1P78357 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CNTNAP1P78357 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CNTNAP1P78357 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms