Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS25P62851 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS25P62851 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS25P62851 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS25P62851 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS25P62851 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS25P62851 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS25P62851 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS25P62851 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS25P62851 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS25P62851 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS25P62851 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS25P62851 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS25P62851 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS25P62851 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS25P62851 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS25P62851 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS25P62851 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS25P62851 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS25P62851 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS25P62851 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS25P62851 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS25P62851 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS25P62851 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS25P62851 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS25P62851 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS25P62851 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS25P62851 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS25P62851 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS25P62851 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS25P62851 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS25P62851 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS25P62851 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS25P62851 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS25P62851 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS25P62851 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS25P62851 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS25P62851 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS25P62851 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS25P62851 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS25P62851 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS25P62851 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS25P62851 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS25P62851 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS25P62851 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS25P62851 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS25P62851 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS25P62851 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS25P62851 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS25P62851 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS25P62851 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS25P62851 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS25P62851 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS25P62851 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS25P62851 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS25P62851 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS25P62851 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS25P62851 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS25P62851 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS25P62851 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS25P62851 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS25P62851 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS25P62851 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS25P62851 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS25P62851 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS25P62851 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS25P62851 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS25P62851 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS25P62851 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS25P62851 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS25P62851 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS25P62851 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms