Protein–RNA interactions for Protein: P62312

LSM6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM6P62312 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM6P62312 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM6P62312 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM6P62312 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSM6P62312 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM6P62312 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM6P62312 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM6P62312 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM6P62312 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM6P62312 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM6P62312 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM6P62312 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM6P62312 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM6P62312 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM6P62312 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM6P62312 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LSM6P62312 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM6P62312 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM6P62312 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM6P62312 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM6P62312 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM6P62312 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM6P62312 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM6P62312 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM6P62312 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM6P62312 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM6P62312 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM6P62312 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM6P62312 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LSM6P62312 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM6P62312 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM6P62312 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM6P62312 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM6P62312 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM6P62312 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM6P62312 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM6P62312 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM6P62312 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM6P62312 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM6P62312 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM6P62312 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM6P62312 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM6P62312 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM6P62312 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM6P62312 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM6P62312 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM6P62312 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM6P62312 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LSM6P62312 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM6P62312 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM6P62312 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM6P62312 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM6P62312 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM6P62312 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM6P62312 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LSM6P62312 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM6P62312 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM6P62312 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM6P62312 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM6P62312 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM6P62312 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms