Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVFRD-1P60508 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ERVFRD-1P60508 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVFRD-1P60508 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ERVFRD-1P60508 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 942.9 ms