Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX9P55771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX9P55771 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX9P55771 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX9P55771 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX9P55771 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX9P55771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX9P55771 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX9P55771 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX9P55771 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX9P55771 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX9P55771 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX9P55771 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX9P55771 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX9P55771 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX9P55771 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX9P55771 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX9P55771 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX9P55771 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX9P55771 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX9P55771 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX9P55771 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX9P55771 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX9P55771 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAX9P55771 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAX9P55771 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX9P55771 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX9P55771 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX9P55771 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX9P55771 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX9P55771 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX9P55771 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX9P55771 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX9P55771 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX9P55771 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX9P55771 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX9P55771 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX9P55771 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX9P55771 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX9P55771 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX9P55771 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX9P55771 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX9P55771 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX9P55771 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX9P55771 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX9P55771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX9P55771 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX9P55771 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX9P55771 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX9P55771 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX9P55771 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX9P55771 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX9P55771 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX9P55771 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX9P55771 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX9P55771 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX9P55771 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAX9P55771 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX9P55771 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX9P55771 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX9P55771 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX9P55771 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX9P55771 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX9P55771 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX9P55771 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX9P55771 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX9P55771 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX9P55771 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX9P55771 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX9P55771 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAX9P55771 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.5 ms