Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GYS2P54840 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GYS2P54840 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GYS2P54840 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GYS2P54840 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GYS2P54840 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GYS2P54840 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GYS2P54840 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GYS2P54840 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GYS2P54840 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GYS2P54840 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GYS2P54840 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GYS2P54840 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GYS2P54840 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GYS2P54840 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GYS2P54840 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GYS2P54840 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GYS2P54840 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GYS2P54840 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GYS2P54840 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GYS2P54840 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GYS2P54840 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GYS2P54840 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GYS2P54840 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GYS2P54840 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GYS2P54840 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GYS2P54840 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GYS2P54840 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GYS2P54840 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GYS2P54840 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GYS2P54840 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GYS2P54840 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GYS2P54840 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GYS2P54840 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GYS2P54840 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GYS2P54840 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GYS2P54840 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GYS2P54840 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GYS2P54840 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GYS2P54840 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GYS2P54840 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GYS2P54840 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GYS2P54840 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GYS2P54840 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYS2P54840 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYS2P54840 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYS2P54840 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GYS2P54840 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GYS2P54840 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GYS2P54840 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GYS2P54840 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GYS2P54840 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYS2P54840 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYS2P54840 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYS2P54840 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GYS2P54840 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYS2P54840 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GYS2P54840 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GYS2P54840 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GYS2P54840 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GYS2P54840 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GYS2P54840 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GYS2P54840 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GYS2P54840 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GYS2P54840 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GYS2P54840 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GYS2P54840 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GYS2P54840 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GYS2P54840 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GYS2P54840 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms