Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGGT1BP53609 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGGT1BP53609 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PGGT1BP53609 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PGGT1BP53609 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PGGT1BP53609 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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