Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LUMP51884 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LUMP51884 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LUMP51884 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LUMP51884 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LUMP51884 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LUMP51884 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LUMP51884 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LUMP51884 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LUMP51884 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LUMP51884 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LUMP51884 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LUMP51884 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LUMP51884 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LUMP51884 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LUMP51884 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LUMP51884 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LUMP51884 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LUMP51884 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LUMP51884 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LUMP51884 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LUMP51884 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LUMP51884 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LUMP51884 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LUMP51884 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LUMP51884 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LUMP51884 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LUMP51884 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LUMP51884 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LUMP51884 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LUMP51884 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LUMP51884 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LUMP51884 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LUMP51884 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LUMP51884 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LUMP51884 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LUMP51884 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LUMP51884 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LUMP51884 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LUMP51884 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LUMP51884 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LUMP51884 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LUMP51884 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LUMP51884 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LUMP51884 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LUMP51884 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LUMP51884 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LUMP51884 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LUMP51884 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LUMP51884 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LUMP51884 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LUMP51884 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LUMP51884 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LUMP51884 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LUMP51884 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms