Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRE11P49959 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRE11P49959 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MRE11P49959 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRE11P49959 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MRE11P49959 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRE11P49959 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRE11P49959 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRE11P49959 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRE11P49959 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRE11P49959 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MRE11P49959 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MRE11P49959 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRE11P49959 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRE11P49959 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRE11P49959 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MRE11P49959 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRE11P49959 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MRE11P49959 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MRE11P49959 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MRE11P49959 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRE11P49959 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRE11P49959 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MRE11P49959 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MRE11P49959 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MRE11P49959 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MRE11P49959 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MRE11P49959 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MRE11P49959 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MRE11P49959 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRE11P49959 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRE11P49959 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRE11P49959 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MRE11P49959 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRE11P49959 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRE11P49959 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MRE11P49959 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRE11P49959 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRE11P49959 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MRE11P49959 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MRE11P49959 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MRE11P49959 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MRE11P49959 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MRE11P49959 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MRE11P49959 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRE11P49959 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MRE11P49959 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRE11P49959 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MRE11P49959 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MRE11P49959 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MRE11P49959 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRE11P49959 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRE11P49959 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MRE11P49959 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MRE11P49959 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MRE11P49959 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MRE11P49959 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRE11P49959 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRE11P49959 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRE11P49959 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRE11P49959 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRE11P49959 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRE11P49959 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MRE11P49959 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MRE11P49959 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRE11P49959 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRE11P49959 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRE11P49959 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRE11P49959 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRE11P49959 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRE11P49959 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRE11P49959 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRE11P49959 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRE11P49959 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRE11P49959 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRE11P49959 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRE11P49959 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRE11P49959 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRE11P49959 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRE11P49959 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRE11P49959 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRE11P49959 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRE11P49959 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRE11P49959 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRE11P49959 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRE11P49959 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRE11P49959 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRE11P49959 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRE11P49959 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRE11P49959 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRE11P49959 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRE11P49959 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRE11P49959 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRE11P49959 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms