Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETV4P43268 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETV4P43268 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ETV4P43268 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETV4P43268 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETV4P43268 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETV4P43268 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ETV4P43268 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETV4P43268 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETV4P43268 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ETV4P43268 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ETV4P43268 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ETV4P43268 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ETV4P43268 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETV4P43268 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ETV4P43268 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ETV4P43268 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETV4P43268 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETV4P43268 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ETV4P43268 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ETV4P43268 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ETV4P43268 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ETV4P43268 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ETV4P43268 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETV4P43268 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETV4P43268 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETV4P43268 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETV4P43268 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ETV4P43268 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ETV4P43268 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ETV4P43268 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ETV4P43268 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ETV4P43268 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ETV4P43268 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ETV4P43268 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ETV4P43268 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ETV4P43268 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ETV4P43268 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ETV4P43268 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ETV4P43268 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETV4P43268 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETV4P43268 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETV4P43268 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETV4P43268 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ETV4P43268 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ETV4P43268 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ETV4P43268 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ETV4P43268 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ETV4P43268 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ETV4P43268 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ETV4P43268 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ETV4P43268 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ETV4P43268 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ETV4P43268 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ETV4P43268 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ETV4P43268 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ETV4P43268 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ETV4P43268 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ETV4P43268 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ETV4P43268 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ETV4P43268 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETV4P43268 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETV4P43268 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETV4P43268 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ETV4P43268 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ETV4P43268 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ETV4P43268 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ETV4P43268 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ETV4P43268 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ETV4P43268 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ETV4P43268 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ETV4P43268 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ETV4P43268 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms