Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDC2P34741 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDC2P34741 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDC2P34741 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDC2P34741 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDC2P34741 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDC2P34741 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDC2P34741 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDC2P34741 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDC2P34741 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDC2P34741 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDC2P34741 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDC2P34741 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDC2P34741 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDC2P34741 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDC2P34741 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDC2P34741 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDC2P34741 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDC2P34741 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDC2P34741 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDC2P34741 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDC2P34741 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDC2P34741 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDC2P34741 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDC2P34741 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDC2P34741 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDC2P34741 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDC2P34741 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDC2P34741 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDC2P34741 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDC2P34741 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDC2P34741 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDC2P34741 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDC2P34741 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDC2P34741 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDC2P34741 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDC2P34741 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDC2P34741 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDC2P34741 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDC2P34741 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDC2P34741 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDC2P34741 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDC2P34741 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDC2P34741 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDC2P34741 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDC2P34741 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDC2P34741 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDC2P34741 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDC2P34741 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDC2P34741 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDC2P34741 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDC2P34741 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDC2P34741 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDC2P34741 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDC2P34741 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDC2P34741 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDC2P34741 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDC2P34741 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDC2P34741 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDC2P34741 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDC2P34741 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDC2P34741 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms